Ян Саудек родился 13 мая 1935 года в Праге.
Фотографией начал заниматься в 1963 году.
К концу 1970-х годов снискал на Западе славу ведущего чешского фотографа, работавшего в теме эротики. При этом до середины 1980-х годов был вынужден работать подпольно, пока в 1984 году власти Чехословакии не дали ему разрешение на работу в качестве фотографа-художника.
Однако и на Западе его работы на тему взаимоотношений мужчины и женщины вплоть до 1990-х годов неоднократно запрещались цензурой к показу и публикации.
Сегодня Саудек – признанный мастер, чьи выставки проходят по всему миру и чьи работы находятся во всех важнейших фотоколлекциях Европы и Америки. Его творчеству посвящено множество альбомов и монографий.
Живет в Праге.